Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2W7

4930518I15Rik, RIKEN cDNA 4930518I15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930518I15RikQ3V2W7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930518I15RikQ3V2W7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms