Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp48Q3V0C5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp48Q3V0C5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms