Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Ttk-202ENSMUST00000185913 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SvipQ3UZP4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms