Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWQ3

Ube2fb, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F-B, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fbQ3UWQ3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ube2fbQ3UWQ3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms