Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW22

Defb48, Beta-defensin 42, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb48Q3UW22 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defb48Q3UW22 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defb48Q3UW22 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms