Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr1d1Q3UV55 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms