Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syndig1lQ3USQ7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms