Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQN2

Fcho2, F-BAR domain only protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 809 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho2Q3UQN2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fcho2Q3UQN2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fcho2Q3UQN2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fcho2Q3UQN2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fcho2Q3UQN2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fcho2Q3UQN2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fcho2Q3UQN2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fcho2Q3UQN2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fcho2Q3UQN2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fcho2Q3UQN2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fcho2Q3UQN2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fcho2Q3UQN2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fcho2Q3UQN2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fcho2Q3UQN2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fcho2Q3UQN2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fcho2Q3UQN2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fcho2Q3UQN2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fcho2Q3UQN2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fcho2Q3UQN2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fcho2Q3UQN2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fcho2Q3UQN2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fcho2Q3UQN2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fcho2Q3UQN2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fcho2Q3UQN2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms