Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms