Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mccc2Q3ULD5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mccc2Q3ULD5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mccc2Q3ULD5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mccc2Q3ULD5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mccc2Q3ULD5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mccc2Q3ULD5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mccc2Q3ULD5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mccc2Q3ULD5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mccc2Q3ULD5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mccc2Q3ULD5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mccc2Q3ULD5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mccc2Q3ULD5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mccc2Q3ULD5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mccc2Q3ULD5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mccc2Q3ULD5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mccc2Q3ULD5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mccc2Q3ULD5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Mccc2Q3ULD5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Mccc2Q3ULD5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Mccc2Q3ULD5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mccc2Q3ULD5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mccc2Q3ULD5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Mccc2Q3ULD5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mccc2Q3ULD5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mccc2Q3ULD5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mccc2Q3ULD5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mccc2Q3ULD5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mccc2Q3ULD5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mccc2Q3ULD5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mccc2Q3ULD5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mccc2Q3ULD5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mccc2Q3ULD5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mccc2Q3ULD5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Mccc2Q3ULD5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mccc2Q3ULD5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Mccc2Q3ULD5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mccc2Q3ULD5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mccc2Q3ULD5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mccc2Q3ULD5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Mccc2Q3ULD5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Mccc2Q3ULD5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Mccc2Q3ULD5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mccc2Q3ULD5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mccc2Q3ULD5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Mccc2Q3ULD5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms