Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smu1Q3UKJ7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms