Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trip13Q3UA06 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms