Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms