Protein–RNA interactions for Protein: Q3U213

Serac1, Protein SERAC1, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serac1Q3U213 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serac1Q3U213 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serac1Q3U213 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serac1Q3U213 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serac1Q3U213 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serac1Q3U213 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serac1Q3U213 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serac1Q3U213 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serac1Q3U213 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serac1Q3U213 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serac1Q3U213 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serac1Q3U213 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Serac1Q3U213 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serac1Q3U213 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serac1Q3U213 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serac1Q3U213 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Serac1Q3U213 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serac1Q3U213 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serac1Q3U213 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serac1Q3U213 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serac1Q3U213 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serac1Q3U213 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serac1Q3U213 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serac1Q3U213 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serac1Q3U213 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serac1Q3U213 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serac1Q3U213 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serac1Q3U213 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serac1Q3U213 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serac1Q3U213 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serac1Q3U213 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serac1Q3U213 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serac1Q3U213 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serac1Q3U213 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serac1Q3U213 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serac1Q3U213 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Serac1Q3U213 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serac1Q3U213 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serac1Q3U213 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serac1Q3U213 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serac1Q3U213 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serac1Q3U213 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serac1Q3U213 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serac1Q3U213 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serac1Q3U213 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serac1Q3U213 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serac1Q3U213 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serac1Q3U213 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Serac1Q3U213 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serac1Q3U213 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serac1Q3U213 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serac1Q3U213 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serac1Q3U213 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serac1Q3U213 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serac1Q3U213 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serac1Q3U213 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serac1Q3U213 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serac1Q3U213 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serac1Q3U213 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serac1Q3U213 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serac1Q3U213 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serac1Q3U213 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serac1Q3U213 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serac1Q3U213 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serac1Q3U213 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serac1Q3U213 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serac1Q3U213 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serac1Q3U213 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serac1Q3U213 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serac1Q3U213 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serac1Q3U213 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serac1Q3U213 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serac1Q3U213 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serac1Q3U213 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serac1Q3U213 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serac1Q3U213 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Serac1Q3U213 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serac1Q3U213 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serac1Q3U213 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serac1Q3U213 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Serac1Q3U213 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serac1Q3U213 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Serac1Q3U213 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serac1Q3U213 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serac1Q3U213 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serac1Q3U213 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serac1Q3U213 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Serac1Q3U213 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Serac1Q3U213 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Serac1Q3U213 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Serac1Q3U213 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Serac1Q3U213 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Serac1Q3U213 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Serac1Q3U213 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Serac1Q3U213 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Serac1Q3U213 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Serac1Q3U213 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Serac1Q3U213 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Serac1Q3U213 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Serac1Q3U213 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms