Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Palb2Q3U0P1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms