Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hace1Q3U0D9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms