Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TchpQ3TVW5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms