Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc136Q3TVA9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc136Q3TVA9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms