Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTY5

Krt2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt2Q3TTY5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt2Q3TTY5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms