Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TTL0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TTL0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TTL0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TTL0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTL0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTL0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms