Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKY6

Cwc27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc27Q3TKY6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cwc27Q3TKY6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cwc27Q3TKY6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cwc27Q3TKY6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cwc27Q3TKY6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cwc27Q3TKY6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cwc27Q3TKY6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cwc27Q3TKY6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cwc27Q3TKY6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cwc27Q3TKY6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cwc27Q3TKY6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cwc27Q3TKY6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cwc27Q3TKY6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cwc27Q3TKY6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cwc27Q3TKY6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cwc27Q3TKY6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cwc27Q3TKY6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cwc27Q3TKY6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cwc27Q3TKY6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cwc27Q3TKY6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cwc27Q3TKY6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cwc27Q3TKY6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cwc27Q3TKY6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cwc27Q3TKY6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cwc27Q3TKY6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cwc27Q3TKY6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cwc27Q3TKY6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cwc27Q3TKY6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cwc27Q3TKY6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cwc27Q3TKY6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cwc27Q3TKY6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cwc27Q3TKY6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cwc27Q3TKY6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cwc27Q3TKY6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cwc27Q3TKY6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cwc27Q3TKY6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cwc27Q3TKY6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cwc27Q3TKY6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cwc27Q3TKY6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cwc27Q3TKY6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms