Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms