Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms