Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccbe1Q3MI99 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccbe1Q3MI99 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccbe1Q3MI99 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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