Protein–RNA interactions for Protein: Q33DR3

Pdss2, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 2, mousemouse

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Length 401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss2Q33DR3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Pdss2Q33DR3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdss2Q33DR3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdss2Q33DR3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdss2Q33DR3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdss2Q33DR3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdss2Q33DR3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdss2Q33DR3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdss2Q33DR3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdss2Q33DR3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdss2Q33DR3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdss2Q33DR3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdss2Q33DR3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdss2Q33DR3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdss2Q33DR3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdss2Q33DR3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdss2Q33DR3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdss2Q33DR3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdss2Q33DR3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdss2Q33DR3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdss2Q33DR3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdss2Q33DR3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdss2Q33DR3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdss2Q33DR3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdss2Q33DR3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdss2Q33DR3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdss2Q33DR3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdss2Q33DR3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdss2Q33DR3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdss2Q33DR3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdss2Q33DR3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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