Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vax1Q2NKI2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vax1Q2NKI2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vax1Q2NKI2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms