Protein–RNA interactions for Protein: Q2HXL6

Edem3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edem3Q2HXL6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edem3Q2HXL6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edem3Q2HXL6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edem3Q2HXL6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edem3Q2HXL6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Edem3Q2HXL6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms