Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
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Cers3Q1A3B0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Cers3Q1A3B0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Cers3Q1A3B0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cers3Q1A3B0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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