Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
R3HDM1Q15032 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
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