Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Spatc1Q148B6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms