Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne7Q0VE82 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne7Q0VE82 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms