Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc7a1Q09143 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms