Protein–RNA interactions for Protein: Q08535

Sct, Secretin, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SctQ08535 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SctQ08535 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SctQ08535 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SctQ08535 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SctQ08535 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SctQ08535 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SctQ08535 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SctQ08535 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SctQ08535 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SctQ08535 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SctQ08535 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SctQ08535 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SctQ08535 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SctQ08535 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SctQ08535 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SctQ08535 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SctQ08535 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SctQ08535 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SctQ08535 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SctQ08535 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SctQ08535 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SctQ08535 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SctQ08535 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SctQ08535 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SctQ08535 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SctQ08535 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SctQ08535 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SctQ08535 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SctQ08535 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SctQ08535 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SctQ08535 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SctQ08535 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SctQ08535 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SctQ08535 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SctQ08535 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SctQ08535 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SctQ08535 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SctQ08535 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SctQ08535 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SctQ08535 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SctQ08535 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SctQ08535 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SctQ08535 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SctQ08535 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SctQ08535 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SctQ08535 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SctQ08535 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SctQ08535 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SctQ08535 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SctQ08535 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SctQ08535 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SctQ08535 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SctQ08535 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SctQ08535 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SctQ08535 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SctQ08535 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SctQ08535 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SctQ08535 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SctQ08535 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SctQ08535 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SctQ08535 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SctQ08535 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SctQ08535 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SctQ08535 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SctQ08535 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SctQ08535 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SctQ08535 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SctQ08535 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SctQ08535 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SctQ08535 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SctQ08535 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SctQ08535 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SctQ08535 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SctQ08535 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SctQ08535 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SctQ08535 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SctQ08535 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SctQ08535 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SctQ08535 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SctQ08535 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SctQ08535 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SctQ08535 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SctQ08535 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SctQ08535 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SctQ08535 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SctQ08535 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SctQ08535 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SctQ08535 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SctQ08535 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SctQ08535 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SctQ08535 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SctQ08535 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SctQ08535 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SctQ08535 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SctQ08535 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SctQ08535 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SctQ08535 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SctQ08535 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SctQ08535 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SctQ08535 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms