Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou6f1Q07916 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms