Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms