Protein–RNA interactions for Protein: Q04742

Emx1, Homeobox protein EMX1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx1Q04742 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms