Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CkbQ04447 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CkbQ04447 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CkbQ04447 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CkbQ04447 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CkbQ04447 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CkbQ04447 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CkbQ04447 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CkbQ04447 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CkbQ04447 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CkbQ04447 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CkbQ04447 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CkbQ04447 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CkbQ04447 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CkbQ04447 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CkbQ04447 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CkbQ04447 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CkbQ04447 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CkbQ04447 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CkbQ04447 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CkbQ04447 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CkbQ04447 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CkbQ04447 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CkbQ04447 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CkbQ04447 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CkbQ04447 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CkbQ04447 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CkbQ04447 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CkbQ04447 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CkbQ04447 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CkbQ04447 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms