Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msx2Q03358 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms