Protein–RNA interactions for Protein: Q03172

Hivep1, Zinc finger protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 2,688 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hivep1Q03172 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hivep1Q03172 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Hivep1Q03172 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Hivep1Q03172 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hivep1Q03172 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Hivep1Q03172 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hivep1Q03172 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hivep1Q03172 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hivep1Q03172 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hivep1Q03172 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hivep1Q03172 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hivep1Q03172 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hivep1Q03172 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hivep1Q03172 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
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Hivep1Q03172 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hivep1Q03172 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Hivep1Q03172 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Hivep1Q03172 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hivep1Q03172 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hivep1Q03172 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hivep1Q03172 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hivep1Q03172 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hivep1Q03172 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hivep1Q03172 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hivep1Q03172 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hivep1Q03172 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hivep1Q03172 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hivep1Q03172 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Hivep1Q03172 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hivep1Q03172 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Hivep1Q03172 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hivep1Q03172 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Hivep1Q03172 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hivep1Q03172 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hivep1Q03172 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hivep1Q03172 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hivep1Q03172 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hivep1Q03172 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hivep1Q03172 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hivep1Q03172 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hivep1Q03172 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms