Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms