Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Muc1Q02496 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Muc1Q02496 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Muc1Q02496 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Muc1Q02496 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Muc1Q02496 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Muc1Q02496 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Muc1Q02496 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Muc1Q02496 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Muc1Q02496 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Muc1Q02496 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Muc1Q02496 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Muc1Q02496 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Muc1Q02496 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Muc1Q02496 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Muc1Q02496 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Muc1Q02496 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Muc1Q02496 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Muc1Q02496 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Muc1Q02496 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Muc1Q02496 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Muc1Q02496 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Muc1Q02496 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Muc1Q02496 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Muc1Q02496 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Muc1Q02496 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Muc1Q02496 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Muc1Q02496 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Muc1Q02496 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Muc1Q02496 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Muc1Q02496 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Muc1Q02496 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Muc1Q02496 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Muc1Q02496 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Muc1Q02496 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Muc1Q02496 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Muc1Q02496 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Muc1Q02496 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Muc1Q02496 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Muc1Q02496 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Muc1Q02496 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Muc1Q02496 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Muc1Q02496 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Muc1Q02496 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms