Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcqQ02111 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms