Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snai1Q02085 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Snai1Q02085 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Snai1Q02085 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Snai1Q02085 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms