Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde1bQ01065 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms