Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrcdQ00LT2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms