Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cds1P98191 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cds1P98191 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cds1P98191 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cds1P98191 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cds1P98191 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cds1P98191 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cds1P98191 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cds1P98191 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cds1P98191 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cds1P98191 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cds1P98191 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cds1P98191 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cds1P98191 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cds1P98191 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cds1P98191 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cds1P98191 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cds1P98191 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cds1P98191 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms