Protein–RNA interactions for Protein: P98154

Dgcr2, Integral membrane protein DGCR2/IDD, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr2P98154 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dgcr2P98154 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dgcr2P98154 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dgcr2P98154 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dgcr2P98154 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dgcr2P98154 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dgcr2P98154 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Dgcr2P98154 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dgcr2P98154 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dgcr2P98154 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Dgcr2P98154 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dgcr2P98154 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dgcr2P98154 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dgcr2P98154 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dgcr2P98154 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dgcr2P98154 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dgcr2P98154 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms