Protein–RNA interactions for Protein: P97950

Rab33a, Ras-related protein Rab-33A, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33aP97950 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab33aP97950 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab33aP97950 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab33aP97950 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab33aP97950 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab33aP97950 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab33aP97950 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab33aP97950 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab33aP97950 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab33aP97950 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab33aP97950 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab33aP97950 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab33aP97950 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab33aP97950 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab33aP97950 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab33aP97950 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab33aP97950 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab33aP97950 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab33aP97950 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab33aP97950 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab33aP97950 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms