Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms