Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bop1P97452 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bop1P97452 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bop1P97452 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bop1P97452 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms